Goles en contra con Quique Flores como entrenador en la temporada

Fecha	Competición	En	Rival	Res	Árbitro	Estadio
28.10.2007	Primera División	Fuera	Sevilla FC	0 - 3	Daudén Ibáñez	Sánchez Pizjuán
24.10.2007	Champions League	Fuera	Rosenborg BK	0 - 2	Craig Thomson	Lerkendal
20.10.2007	Primera División	Fuera	Deportivo Coruña	4 - 2	Turienzo Álvarez	Riazor
06.10.2007	Primera División	Casa	RCD Espanyol	1 - 2	Velasco Carballo	Mestalla
03.10.2007	Champions League	Casa	Chelsea FC	1 - 2	Roberto Rosetti	Mestalla
26.09.2007	Primera División	Casa	Getafe CF	2 - 1	Fernández Borbalán	Mestalla
23.09.2007	Primera División	Fuera	Real Betis	2 - 1	Clos Gómez	Benito Villamarín
15.09.2007	Primera División	Casa	Real Valladolid	2 - 1	Ramírez Domínguez	Mestalla
02.09.2007	Primera División	Fuera	UD Almería	2 - 1	Iturralde González	Juegos Mediterráneos
29.08.2007	Champions League	Fuera	IF Elfsborg	2 - 1	Yuri Baskakov	Boras Arena
26.08.2007	Primera División	Casa	Villarreal CF	0 - 3	Pérez Lasa	Mestalla
18.08.2007	Trofeo Naranja	Casa	Parma AC	0 - 2	Rubinos Pérez	Mestalla
29.07.2007	Pretemporada	Neutral	Paris Saint-Germain	0 - 3	Andre Marriner	Emirates Stadium
17.06.2007	Primera División	Casa	Real Sociedad	3 - 3	Teixeira Vitienes, F.	Mestalla
09.06.2007	Primera División	Fuera	Levante UD	2 - 4	Clos Gómez	Ciudad de Valencia
26.05.2007	Primera División	Casa	Villarreal CF	2 - 3	Rubinos Pérez	Mestalla
05.05.2007	Primera División	Fuera	Deportivo Coruña	2 - 1	Álvarez Izquierdo	Riazor
21.04.2007	Primera División	Fuera	Real Madrid	1 - 2	Pérez Lasa	Santiago Bernabéu
10.04.2007	Champions League	Casa	Chelsea FC	1 - 2	Kyros Vassaras	Mestalla
07.04.2007	Primera División	Fuera	Athletic de Bilbao	0 - 1	Mejuto González	San Mamés
04.04.2007	Champions League	Fuera	Chelsea FC	1 - 1	Frank De Bleeckere	Stamford Bridge
31.03.2007	Primera División	Casa	RCD Espanyol	3 - 2	Teixeira Vitienes, F.	Mestalla
20.03.2007	Amistoso	Casa	Colorado Rapids	4 - 3	Ayza Gámez	Mestalla
17.03.2007	Primera División	Casa	Racing de Santander	0 - 2	Rodríguez Santiago	Mestalla
11.03.2007	Primera División	Fuera	CA Osasuna	1 - 1	Medina Cantalejo	El Sadar
25.02.2007	Primera División	Fuera	Gimnàstic de Tarragona	1 - 1	González Vázquez	Nou Estadi
21.02.2007	Champions League	Fuera	Inter Milán	2 - 2	Martin Hansson	Giuseppe Meazza
18.02.2007	Primera División	Casa	FC Barcelona	2 - 1	Iturralde González	Mestalla
11.02.2007	Primera División	Fuera	Getafe CF	0 - 3	Delgado Ferreiro	Alfonso Pérez
03.02.2007	Primera División	Casa	Atlético de Madrid	3 - 1	Pérez Burrull	Mestalla
28.01.2007	Primera División	Fuera	Real Betis	1 - 2	Turienzo Álvarez	Benito Villamarín
17.01.2007	Copa del Rey	Casa	Getafe CF	2 - 4	Ramírez Domínguez	Mestalla
10.01.2007	Copa del Rey	Fuera	Getafe CF	1 - 1	Rodríguez Santiago	Alfonso Pérez
19.12.2006	Primera División	Casa	RCD Mallorca	3 - 1	Velasco Carballo	Mestalla
05.12.2006	Champions League	Fuera	AS Roma	0 - 1	Konrad Plautz	Olímpico de Roma
02.12.2006	Primera División	Fuera	Recreativo de Huelva	0 - 2	Undiano Mallenco	Nuevo Colombino
26.11.2006	Primera División	Casa	Real Madrid	0 - 1	Medina Cantalejo	Mestalla
18.11.2006	Primera División	Fuera	Sevilla FC	0 - 3	Megía Dávila	Sánchez Pizjuán
11.11.2006	Primera División	Casa	Athletic de Bilbao	1 - 1	Mejuto González	Mestalla
05.11.2006	Primera División	Fuera	RCD Espanyol	1 - 1	Ramírez Domínguez	Montjuic
31.10.2006	Champions League	Fuera	Shakhtar Donetsk	2 - 2	Peter Fröjdfeldt	Olympiyskiy
28.10.2006	Primera División	Fuera	Racing de Santander	0 - 1	Rubinos Pérez	El Sardinero
25.10.2006	Copa del Rey	Fuera	Racing Portuense	2 - 1	Muñiz Fernández	José del Cuvillo
15.10.2006	Primera División	Fuera	Celta de Vigo	2 - 3	Iturralde González	Balaídos
27.09.2006	Champions League	Casa	AS Roma	2 - 1	Herbert Fandel	Mestalla
24.09.2006	Primera División	Fuera	FC Barcelona	1 - 1	Daudén Ibáñez	Camp Nou
12.09.2006	Champions League	Fuera	Olympiakos CFP	4 - 2	Terje Hauge	Georgios Karaiskakis
26.08.2006	Primera División	Casa	Real Betis	2 - 1	Muñiz Fernández	Mestalla
09.08.2006	Champions League	Fuera	FC Salzburg	0 - 1	Peter Fröjdfeldt	Wals-Siezenheim
29.07.2006	Pretemporada	Casa	Charlton Athletic	3 - 1	Mateu Lahoz	Mestalla
20.07.2006	Pretemporada	Neutral	Fenerbahçe SK	2 - 1	Kevin Blom	Sportpark Mulderssingel
16.07.2006	Pretemporada	Neutral	Go Ahead Eagles	2 - 1	Tom Van Sichem	Sportzentrum Terwolde
16.05.2006	Primera División	Fuera	CA Osasuna	1 - 2	Rodríguez Santiago	El Sadar
06.05.2006	Primera División	Casa	Atlético de Madrid	1 - 1	Puentes Leira	Mestalla
03.05.2006	Primera División	Fuera	RCD Mallorca	1 - 2	Pérez Burrull	Son Moix
02.04.2006	Primera División	Casa	Cádiz CF	5 - 3	Muñiz Fernández	Mestalla
26.03.2006	Primera División	Fuera	Sevilla FC	0 - 1	Turienzo Álvarez	Sánchez Pizjuán
22.03.2006	Primera División	Casa	Villarreal CF	1 - 1	Fernández Borbalán	Mestalla
19.03.2006	Primera División	Fuera	Racing de Santander	1 - 2	Medina Cantalejo	El Sardinero
26.02.2006	Primera División	Casa	Getafe CF	1 - 1	Pérez Lasa	Mestalla
19.02.2006	Primera División	Fuera	Real Sociedad	2 - 1	Fernández Borbalán	Anoeta
01.02.2006	Copa del Rey	Casa	Deportivo Coruña	1 - 1	Megía Dávila	Mestalla
29.01.2006	Primera División	Casa	Real Zaragoza	2 - 2	González Vázquez	Mestalla
19.01.2006	Copa del Rey	Fuera	Deportivo Coruña	0 - 1	Iturralde González	Riazor
14.12.2005	Amistoso	Fuera	Al Hilal	1 - 2	Khalil Jalal	King Fahd Stadium
10.12.2005	Primera División	Casa	Athletic de Bilbao	1 - 1	Mejuto González	Mestalla
04.12.2005	Primera División	Fuera	RCD Espanyol	3 - 1	Pérez Lasa	Montjuic
09.11.2005	Amistoso	Fuera	SC Requena	3 - 1	Fernández Meca	Tomás Berlanga
05.11.2005	Primera División	Fuera	Villarreal CF	0 - 1	Iturralde González	El Madrigal
30.10.2005	Primera División	Casa	Racing de Santander	1 - 1	Pino Zamorano	Mestalla
27.10.2005	Primera División	Casa	Sevilla FC	0 - 2	Undiano Mallenco	Mestalla
23.10.2005	Primera División	Fuera	Real Madrid	2 - 1	Daudén Ibáñez	Santiago Bernabéu
16.10.2005	Primera División	Casa	Málaga CF	2 - 1	Pérez Lasa	Mestalla
05.10.2005	Amistoso	Neutral	Villarreal CF	4 - 3	Ayza Gámez	La Murta
01.10.2005	Primera División	Fuera	Getafe CF	1 - 2	Pérez Lima	Alfonso Pérez
24.09.2005	Primera División	Casa	Real Sociedad	2 - 1	Rubinos Pérez	Mestalla
21.09.2005	Primera División	Fuera	FC Barcelona	2 - 2	Mejuto González	Camp Nou
17.09.2005	Primera División	Casa	Deportivo Coruña	2 - 2	Iturralde González	Mestalla
11.09.2005	Primera División	Fuera	Real Zaragoza	2 - 2	Undiano Mallenco	La Romareda
14.08.2005	Trofeo Naranja	Casa	Udinese	0 - 1	Iturralde González	Mestalla
12.08.2005	Trofeo Naranja	Casa	Olympiakos CFP	1 - 3	Pino Zamorano	Mestalla
09.08.2005	Intertoto	Fuera	Hamburgo SV	0 - 1	Stuart Dougal	Imtech Arena
12.07.2005	Pretemporada	Casa	Girondins de Burdeos	0 - 1	Lizondo Cortés	Mestalla