| Goles marcados por Rubén Baraja en la temporada 2002-2003 |
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| Fecha | Competición | En | Rival | Goles | Árbitro | Estadio |
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| 01.09.2002 | Primera División | Fuera | RCD Mallorca | 1 | Undiano Mallenco | Son Moix |
| 29.09.2002 | Primera División | Casa | Rayo Vallecano | 1 | Iturralde González | Mestalla |
| 19.10.2002 | Primera División | Fuera | Atlético de Madrid | 1 | Ramírez Domínguez | Vicente Calderón |
| 23.02.2003 | Primera División | Fuera | Rayo Vallecano | 1 | González Vázquez | Vallecas |
| 23.03.2003 | Primera División | Casa | RCD Espanyol | 1 | Pérez Pérez | Mestalla |
| 17.09.2002 | Champions League | Casa | Liverpool FC | 1 | Herbert Fandel | Mestalla |
| 02.10.2002 | Champions League | Casa | FC Basel | 1 | Cosimo Bolognino | Mestalla |
| 22.10.2002 | Champions League | Fuera | FC Basel | 1 | Helmut Fleischer | St. Jakob Park |
| 22.04.2003 | Champions League | Casa | Inter Milán | 1 | Milton Nielsen | Mestalla |