| Goles marcados por Manuel Fernandes en la temporada 2008-2009 |
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| Fecha | Competición | En | Rival | Goles | Árbitro | Estadio |
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| 05.10.2008 | Primera División | Fuera | Real Valladolid | 1 | Muñiz Fernández | José Zorrilla |
| 09.11.2008 | Primera División | Fuera | Getafe CF | 1 | Undiano Mallenco | Alfonso Pérez |