Interior derecho natural de Córdoba y formado en las categorías inferiores del conjunto andaluz, su buen rendimiento en la temporada 2001-2002 le convirtieron en internacional sub-19. En enero de 2003 el Valencia CF decide fichar al joven jugador como una apuesta de futuro, en una operación en la que el valencianista Dennis Serban es cedido al club cordobés hasta junio de 2003. Juanlu disputa esa media temporada un total de 12 partidos con el filial valencianista.

Debutó con el primer equipo el 24 de agosto de 2003, en partido amistoso frente a su ex-equipo, el Córdoba CF, jugando posteriormente en el filial del Valencia, completando 33 partidos de Liga en Segunda División B. En la temporada 2004-2005 debutó en Primera División, en la vigésima jornada de Liga, frente al Villarreal en el Madrigal, pero pese a salir como suplente, únicamente disputó 40 minutos puesto que fue sustituido en la segunda mitad.

Completó la pretemporada 2005-2006 con el primer equipo, e incluso jugó varios partidos de la Intertoto, pero finalmente marchó cedido a la UE Lleida, donde disputó 23 partidos en Segunda División En el verano de 2006 ficha por el Hércules CF, la misma categoría en la que militarán sus siguientes equipos, el Granada 74 y el CD Tenerife. En la temporada 2008-2009, consigue el ascenso a la Primera División con el equipo canario, disputando un total de 35 partidos y marcando 4 goles. En la temporada 2011-2012 ficha por el Girona FC, donde permanece cuatro temporadas hasta que, en el verano de 2015 ficha por el FC Cartagena. Con el conjunto murciano disputa 65 partidos en Segunda B durante las dos temporadas en las que permanece allí. En 2017 firma con el Mérida AD.