Nacido en Madrid, Ernesto Burgos se formó en las categorías inferiores del Valencia CF debutando en el Mestalla bajo las órdenes de Mundo el 17 de abril de 1966 en partido de Copa contra el Atlético de Madrid, en el que el equipo filial arrancó un empate sin goles en el campo de Manzanares. Sabino Barinaga le hizo debutar con el primer equipo en mayo de 1966 en un amistoso contra el Wiener Sportklub en Mestalla, en un estreno espectacular en el que marcó dos de los seis goles del equipo. Su trepidante irrupción le valió para enrolarse con la primera plantilla en la gira sudamericana de final de curso, en la que jugó tres amistosos y marcó dos goles. La temporada siguiente, ya con Mundo como técnico del Valencia, fue ascendido al primer equipo, pero no llegó a jugar ningún partido oficial. Participó en algunos amistosos y jugó cuatro partidos con el Mestalla en los que marcó un gol.

La temporada siguiente, Burgos marchó cedido al Atlético Ceuta, donde marcó 3 goles en 10 partidos en la categoría de plata. Volvió al filial valencianista, donde se mantuvo hasta 1970. La temporada siguiente la jugó en el Levante, donde jugó como interior izquierdo proclamándose máximo goleador del equipo. Su buena campaña le sirvió para firmar con el Sabadell, llegando a jugar 4 partidos en Primera División y logrando marcar su primer y único gol en la máxima categoría el 21 de noviembre de 1971 en la Creu Alta frente al Deportivo de La Coruña.