José Caeiro nació en Fuenterrabía, Guipúzcoa, donde dio sus primeros pasos como futbolista. Del equipo local pasó al Karizpe, y a los 19 años, en la temporada 1944-1945, fichó por el Racing de Ferrol, con el que debutó en Segunda División el 24 de septiembre de 1944 contra la Real Sociedad. Permaneció cuatro temporadas en el club gallego, con un muy buen rendimiento y actuaciones muy destacadas. En 1948 firmó con la Real Sociedad, club con el que logró el ascenso a Primera División. Jugó tres campañas en el club donostiarra, en el que jugó un total de 73 partidos de Liga en los que anotó 53 goles.

Caeiro llegó al Valencia en el verano de 1951, con 26 años de edad, y unos números demoledores. Había marcado 115 goles en 165 partidos entre Primera y Segunda División. Todo apuntaba a que triunfaría en Mestalla, pero no fue así. Se trataba de un delantero fuerte, con buena planta y llegada, y con veteranía y experiencia, pero en el equipo che pareció amilanarse. Tuvo muchos problemas con las lesiones, saliendo casi a una por partido jugado. Además, tenía que competir por un puesto con Badenes, que por entonces salía casi a un gol por partido.

El balance de la temporada 1951-1952 fue malo. Jugó dos amistosos y nueve partidos de Liga, sin llegar a estrenarse como goleador. Al finalizar la campaña, se marchó al Hércules, donde siguió haciendo gala de sus dotes realizadoras, al marcar 16 goles en 23 partidos de Segunda División. Esto aumentó aún más las dudas acerca de por qué no había conseguido triunfar en Valencia. Finalizada la temporada, fichó por el Stade Rennais, donde también tuvo un notable rendimiento en la Liga francesa. Volvió al Racing de Ferrol en 1958, y se retiró con 33 años al finalizar la Liga.

José Caeiro falleció el 14 de enero de 1981, en El Ferrol, a los 55 años de edad.